Начата постройкой в 1462 г. В 1500 и 1541 гг. повреждена пожарами, в 1507 г. при пожаре повреждена взрывом пороха, хранившегося в приделе. В середине XVI в. для хранения боеприпасов и товаров возвели в южном углу буя (ограды) кубическое здание палаты со складами и подвалами внизу, маленькой церковью во втором ярусе и четырехпролетной звонницей, которую в XVIII веке заменили восьмигранной колокольней.
В 1640 г. с юга пристроен придел св. Саввы, в 1833 г. с севера — св. Митрофана Воронежского.
В Великую Отечественную войну серьёзно повреждена, интерьеры утрачены, колокольня разрушена.
После войны и до 2008 г. в церкви располагалась переплётная мастерская.
С 2008 г. в распоряжении РПЦ.
Решением 43-й сессии комитета всемирного наследия ЮНЕСКО 7 июля 2019 года внесена в список всемирного наследия ЮНЕСКО (в списке храмов псковской архитектурной школы).
Объект культурного наследия России федерального значения рег. №: 601520271640006. Объект всемирного наследия.
Самара Дата: 15 мая 2023 г.