В XVII в. разрушили обветшавшую звонницу собора, находившуюся на Персях, и возвели восьмигранную колокольню. Построена в XVIII веке. В ней находятся: церковная библиотека, музей, пресс-служба Епархии, паломническая служба "Ветроград".
Приблизительно на месте теперешней колокольни Троицкого собора стояла башня у Лубяного всхода, или Средняя Кремлевская. Есть предположение, что нижняя часть колокольни переделана из этой башни. Лубяной всход вел в Кремль со стороны Псковы от Рыбного торга. В XV веке в башне этой „снедь блюли (хранили) собакам на ядь"—собакам, охранявшим Кремль от воров.