Начата постройкой в 1857 г. на средства, выделенные жителям Ошмян после пожара 1837 г. Ограниченность общины в финансах стала причиной многолетней приостановки строительства, в итоге синагога была открыта в 1912 г.
Закрыта в 1940 г. Использовалась под хозяйственные нужды, реставрационных работ не проводилось, вследствие приспособления здания под склад интерьеры частично утрачены.
В декабре 2012 г. здание передали отделу идеологической работы, культуры и по делам молодежи Ошмянского райисполкома, а с 2014 г. открыли для посещения.
Историко-культурная ценность Республики Белоруссия.