Церковь в честь святой великомученицы Варвары построена на средства купца Андрея Федоровича Сисоева как храм-притвор средневековой Петропавловской церкви.
Закрыт в 1930-е гг. Восточная часть здания со световым восьмигранным барабаном и главой разобрана в 1962-1963 гг. при восстановлении первоначальных форм храма Петра и Павла. Тогда же разделили объемы двух храмов.
Передан местной епархии РПЦ в 1994 г.; в 1997-1998 гг. проведена реставрация верхних ярусов колокольни.
Часть помещений используется под нужды епархиального православного молодежного духовного центра.
Памятник архитектуры федерального значения. Номер объекта: 6710007002 / 671510256590026.