Храм возвели православные греки над древней капеллой монастыря, встроенной в новое здание в качестве крипты. Украшен золотыми куполами с двумя колокольнями. Внутри церковь имеет продольный неф со сводами, которые напоминают бочки. Иконостас с 44 иконами отделяет зал от апсиды – древнейшей части церкви. Здесь находятся древние мозаики и фрески, а также свидетельство того, что монахини в этом монастыре демонстрировали левую руку Иоанна Предтечи. Именно от монастыря начинается Крестный ход в день Богоявления (крещенский сочельник). В остальное время паломников к священной реке не допускают, поскольку граница между Иорданией и Израилем проходим по самой реке.