Отстроена заново при перестройке детинца в XV веке как глухая (непроезжая).
В 1660-е гг. башня ремонтировалась, а с конца века входит в комплекс зданий Воеводского двора.
С начала XIX века в башне была женская тюрьма а башню называли часто ещё и «темнишной», а с 1898 года — богадельня «для престарелых обоего пола», к 1917 гю остались только «призреваемые престарелые женщины».
С 1920-х гг. в Покровской башне размещались архивы. В 1968 году по проекту А. В. Воробьёва башня была реставрирована в формах XVI века, после чего разместили в ней знаменитый в Новгороде ресторан «Детинец».
Объект культурного наследия № 5310033009. Объект всемирного наследия.